选择离子交流树脂的通常原则是选择交流容量大、易于再生使用、同时使用耐久的树脂。详细而言：
（1）交流容量是离子交流树脂使用性能的一个主要指标，相互交流易于越大则同体积的树脂能吸附的离子越多，一个相互交流周期的制水量也越大。通常情形下，弱酸或弱碱性树脂比强酸或强碱性的树脂交流容量大。另外，在同类型树脂中，由于树脂的交联度有所差别，交流容量也有所差别。通常交联度小的树脂交流容量大
；交联度大的树脂交流容量小。因此在选择树脂时要注重。
（2）要凭证原水里需要除去离子的性子来选择树脂。若是只需要除去水里相互交流吸附性弱的离子时，则务必选用强酸或强碱性树脂。
（3）要凭证出水水质要求来选择树脂。若是只需要部分除盐的系统，可以选用强酸性阳树脂和弱碱性阴树脂相互配合使用。关于务必完全除盐的纯水或高纯水系统，则要选择吸附性较强的强酸性阳离子相互交流树脂和旨碱性阴离子相互交流树脂相互配合使用，以除去较难吸附的离子。
（4）要凭证原水里杂质的因向来选择树脂。如原水里有机物较多，或除去离子的半径较大时，应中选用交联孔直径较大的树脂。尽可能的选择高强度多孔性树脂。
（5）用于混淆床的树脂，较多的是强酸-强碱性树脂的组合。但要思量混淆床树脂再生使用时分层易于，因此，要求两种树脂的湿真密度之差应大一些，通常应不小于15%～20%。另外，还要思量到混淆床运行时相互交流流速较量大，树脂磨损较为严重的情形，故应选择耐磨性的树脂。
（6）要凭证除盐水工艺要求来选择树脂。例如双室床，选用强、弱性树脂相互配合使用，由于弱性树脂易于再生使用，对再生剂的质量要求也较量低，可以使用强性树脂再生后的再生液来再生弱性树脂，这样，再生剂的消耗低，制水本钱低。